EBF3 CRISPR Activationプラスミド (h): sc-402181-ACT
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- EBF3 CRISPR Activationプラスミド (h)は、特異的に遺伝子の発現量を増加させるため、相乗的活性化メディエーター(SAM)転写活性化システムです。
- EBF3 CRISPR Activationプラスミド (h)は、1:1:1の質量比で以下の3つのプラスミドがら成る：トランス活性化ドメインVP64に溶解する非活性化されたCas9 (dCas9)ヌクレアーゼ(D10A と H840A)をコード化したのプラスミド（ブラストサイジン耐性遺伝子を含めて）、MS2-p65-HSF1融合蛋白質をコード化したのプラスミド（ハイグロマイシン耐性遺伝子を含めて）、2つのMS2 RNAアプタマーに溶解する目標特異的な20ntガイドRNAをコード化したのプラスミド（ピューロマイシン耐性遺伝子を含めて）。
- 得られたSAM複合体は、部位特異的な約200-250nt転写開始点の上流の領域に結合し、転写因子の強いリクルートメントを提供し、遺伝子の高い活性化効果が得られます。
- EBF3 CRISPR活性化プラスミド（h）およびEBF3 CRISPR活性化プラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、EBF3転写開始点の上流にある異なる調節領域を標的としています。いずれか一方、または両方のデザインが利用可能である可能性があります
- トランスフェクションの後、遺伝子ノックアウト効果は、抗体を用いたWB、IFまたはIHCによって検定されることができます: EBF3 抗体 (N7Q): sc-81999
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
EBF3 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-402181-ACT | 20 µg | $397.00 |
EBF3（early B-cell factor 3）はヘリックス・ループ・ヘリックス型の転写因子で、DNAに結合して遺伝子発現プログラムを制御し、神経細胞の分化や成熟、さらに広範な発生パターン形成を調節します。ヒト細胞では、EBF3は系譜決定に関わる転写ネットワークに寄与し、クロマチンや補因子複合体と協調して細胞状態の遷移や組織特異的な遺伝子制御を形作ります。EBF3の発現や機能の破綻は、神経発達に関わる表現型や、さまざまな疾患状況で観察される転写回路の変化と関連づけられており、発生に関わる遺伝子制御ネットワークを解析する上で有用な結節点となります。EBF3依存的な経路を研究することで、転写のタイミングやプロモーター／エンハンサーの選択が細胞運命決定やストレス応答性の転写にどのように影響するかを明らかにできます。
EBF3 CRISPR活性化プラスミド（h）は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性EBF3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
EBF3 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における EBF3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異（D10AおよびN863A）を有する、触媒活性のないCas9（dCas9）を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はEBF3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性EBF3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のEBF3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるEBF3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびEBF3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるEBF3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。