DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (bovine): sc-437356

概要

DDX21は核小体に局在するDEAD-box型RNAヘリカーゼをコードしており、pre-rRNAの転写およびプロセシングを含むリボソーム生合成の複数段階を統合的に制御し、RNAポリメラーゼI依存的な核小体機能を支えます。RNAリモデリング活性を介して、DDX21はrRNA成熟を、細胞周期の進行、プロテオスタシス、ならびに細胞ストレス応答に影響するより広範なRNA代謝プログラムと結び付ける役割を担います。DDX21機能の撹乱は、核小体の構造的完全性や翻訳能の変化と関連しており、これらの過程は増殖シグナル、ゲノム安定性、ストレス適応表現型といった文脈でしばしば研究対象となります。ウシ系では、DDX21は成長・発生の機構解明、リボソーム産生量に影響する宿主—病原体相互作用、ならびに核小体に連動した遺伝子発現制御の研究において重要です。

DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（bovine）は、bovine細胞株における遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、DDX21タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、DDX21シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• DDX21の機能に不可欠なエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• DDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（bovine）およびDDX21 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（bovine2）によってコードされるgRNAは、遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  DDX21 HDRプラスミド（bovine）および DDX21 HDRプラスミド（bovine2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定の標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。