CLK1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-419688

概要

Clk1 は CDC 様キナーゼ1（CLK1）をコードしており、セリン／アルギニンに富む（SR）スプライシング因子をリン酸化する二重特異性プロテインキナーゼで、スプライソソームの動態制御に関与します。選択的スプライシングおよび pre-mRNA プロセシングの調節を通じて、CLK1 は細胞周期の進行、分化、ストレス適応的な遺伝子発現を司る転写プログラムに寄与します。CLK1 活性は、細胞ストレスや増殖シグナルに応答する経路を含む RNA プロセシングを調整するシグナルネットワークと交差し、それによってプロテオームの多様性に影響を与えます。CLK ファミリーキナーゼ活性の破綻や異常なスプライシングパターンは、複数の疾患関連表現型に関与することが示唆されており、マウス Clk1 は発生および病態における RNA プロセシングの機構研究に有用な結節点となります。

CLK1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるClk1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Clk1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Clk1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CLK1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CLK1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Clk1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CLK1の機能に不可欠なClk1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Clk1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CLK1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびCLK1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Clk1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CLK1 HDRプラスミド（m）および CLK1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはClk1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のClk1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。