Cdx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-402522

概要

CDX1は、カウダル型ホメオボックス転写因子Cdx1をコードする遺伝子であり、配列特異的にDNAへ結合して転写を制御します。Cdx1は前後軸（頭尾軸）のパターニングに関与するとともに、腸管上皮の分化を支えます。Cdx1はホメオボックスに基づく転写プログラムの一部として機能し、腸の発生、細胞運命決定、領域アイデンティティの形成に影響するWnt/β-カテニンシグナル伝達などの経路とも連携します。CDX1の発現異常は、分化制御の破綻や増殖シグナルの異常がしばしば見られる大腸腫瘍など、消化管疾患の文脈で報告されています。系譜関連転写因子として、CDX1は上皮成熟の機構、化生様の遺伝子プログラム、転写ネットワークの再編成を研究する際に頻用されています。

Cdx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCDX1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CDX1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CDX1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、Cdx1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、Cdx1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CDX1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• Cdx1の機能に不可欠なCDX1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CDX1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• Cdx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびCdx1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CDX1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  Cdx1 HDRプラスミド（h）および Cdx1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCDX1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCDX1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。