C/EBP β CRISPR Activation Plasmid (r): sc-437357-ACT

CCAAT/enhancer-binding protein beta (C/EBPβ) ist ein basischer Leucin-Zipper-Transkriptionsfaktor, der in Rattenzellen die Festlegung von Zelllinien und die reizabhängige Transkription koordiniert. Er integriert Signale aus entzündlichen und metabolischen Signalwegen, darunter durch Zytokine aktivierte JAK/STAT- und MAPK-Kaskaden, um Gene zu regulieren, die an Akutphasenreaktionen, Adipogenese und Makrophagenaktivierung beteiligt sind. Die Aktivität von C/EBPβ beeinflusst die Zellzykluskontrolle, Differenzierung und Stressanpassung durch kontextabhängige Bindung an Promotoren und Enhancer. Eine fehlregulierte C/EBPβ-Signalgebung wurde mit abweichenden Entzündungsreaktionen, metabolischer Dysfunktion und proliferativen Phänotypen in Verbindung gebracht, was C/EBPβ zu einem nützlichen Knotenpunkt für die Modellierung krankheitsrelevanter Transkriptionsprogramme macht.

C/EBP β Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (r) bietet einen gezielten, nicht-destruktiven Ansatz zur Hochregulierung der endogenen -Expression, ohne die zugrunde liegende DNA-Sequenz zu verändern.

C/EBP β Das CRISPR-Aktivierungsplasmid (r) ist ein aus drei Plasmiden bestehendes synergistisches Aktivierungsmediator-System (SAM), das für eine hocheffiziente, ortsspezifische transkriptionelle Hochregulation des -Lokus in menschlichen Zelllinien entwickelt wurde. Das System basiert auf einem katalytisch inaktiven Cas9 (dCas9), das zwei inaktivierende Mutationen (D10A und N863A) trägt, welche die Nukleaseaktivität eliminieren, während die DNA-Bindung erhalten bleibt. Dieses dCas9 ist mit VP64, einem potenten Transkriptionsaktivator, fusioniert und wird zusammen mit einem Blasticidin-Resistenzgen zur Selektion koexprimiert. Das zweite Plasmid kodiert das MS2-p65-HSF1-Fusionsprotein, einen sekundären Aktivatorkomplex, der zusammen mit dCas9-VP64 wirkt, sowie ein Hygromycin-Resistenzgen. Das dritte Plasmid kodiert für eine zielspezifische 20-nt-sgRNA, die an zwei MS2-RNA-Aptamere fusioniert ist, welche den MS2-p65-HSF1-Komplex an die Aktivierungsstelle rekrutieren, begleitet von einem Puromycin-Resistenzgen. Die drei Plasmide werden im Massenverhältnis 1:1:1 verabreicht, um eine ausgewogene Expression aller Systemkomponenten zu gewährleisten.

Nach der Assemblierung am Zielort bindet der SAM-Komplex etwa 200 bp stromaufwärts der -Transkriptionsstartstelle, wo VP64, p65 und HSF1 gemeinsam die Transkriptionsmaschinerie rekrutieren und die Hochregulation der endogenen C/EBP β-Expression vorantreiben. Im Gegensatz zu nukleaseaktivem Cas9 verursacht dCas9 keine Doppelstrangbrüche und verändert die genomische Sequenz nicht, wodurch der native -Locus erhalten bleibt und die Untersuchung von C/EBP β-abhängigen Transkriptionsreaktionen am endogenen Locus ermöglicht wird. Dies macht es zu einem wertvollen Werkzeug für Funktionsstudien, die Identifizierung von Zielgenen und die Modellierung der Wiederherstellung des C/EBP β-Signalwegs in Tumorzellen mit stillgelegtem oder reduziertem -Ausdruck.

Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische oder therapeutische Zwecke bestimmt.