BCDIN3D CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406497

概要

BCDIN3D（BCDIN3D RNAメチルトランスフェラーゼ）はSAM依存性のメチルトランスフェラーゼで、RNA末端修飾に関与すると考えられており、特定の前駆体マイクロRNAの5′-一リン酸に対する活性が報告されています。miRNAの成熟や小分子RNAの安定性を変化させることで、BCDIN3Dは細胞状態の移行、増殖、ストレス応答を形作る転写後遺伝子制御プログラムに影響を及ぼし得ます。機能解析では、BCDIN3D発現の異常がmiRNAプロファイルの変化や腫瘍生物学に関連する表現型（特定の細胞状況における浸潤能や転移能の変化など）と結び付くことが示されています。このためBCDIN3Dは、RNAプロセシングとがん原性シグナル伝達、ならびに遺伝子発現のエピジェネティック様制御をつなぐ経路の文脈で、しばしば検討されています。

BCDIN3D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるBCDIN3D遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、BCDIN3D内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、BCDIN3Dのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、BCDIN3Dタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、BCDIN3Dシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、BCDIN3D欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• BCDIN3Dの機能に不可欠なBCDIN3Dエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、BCDIN3Dゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• BCDIN3D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびBCDIN3D CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、BCDIN3D遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  BCDIN3D HDRプラスミド（h）および BCDIN3D HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはBCDIN3Dホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のBCDIN3D標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。