Zscan4c阻害剤と呼ばれる化学クラスは、様々な生物学的経路や分子機構を標的とすることにより、Zscan4cタンパク質の機能やその発現を阻害することができる分子で構成されている。これらの化合物はZscan4cの直接的なアンタゴニストではないが、細胞環境の変化を通してその活性やレベルに影響を与えることができる。例えば、1,10-フェナントロリンとピリチオン亜鉛は、Zscan4cのジンクフィンガードメインの構造的完全性とDNA結合能力の中心である亜鉛イオンの利用可能性を変化させることができる。5-アザシチジンやトリプトライドのような化合物は、転写調節を変化させ、Zscan4cの発現レベルに影響を与える可能性がある。一方、クロロキンやトリコスタチンAは、それぞれDNA複製やクロマチンリモデリングを阻害し、Zscan4cの発現や機能にさらに影響を与える可能性がある。
Zscan4cのようなタンパク質は、酸化還元バランスと金属イオンのホメオスタシスを含む、正確な細胞内状況に依存している。オーラノフィンとジスルフィラムはこれらの条件に影響を与え、Zscan4cの正しい機能に影響を与える可能性がある。同様に、MAPK経路の阻害剤であるPD98059は、Zscan4cのようなタンパク質の転写制御に下流で影響を及ぼす可能性がある。MG132は、プロテアソームの機能を阻害することにより、細胞内にタンパク質を蓄積させ、おそらくミスフォールドしたZscan4cタンパク質の分解を増加させる。シスプラチンは、DNAの架橋を引き起こすことにより、Zscan4cがDNA標的と適切に相互作用するのを妨げる可能性がある。最後に、スミソナイトのような化合物は、ジンクフィンガータンパク質の機能に不可欠な亜鉛の恒常性を乱す可能性がある。
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