ZNF462の化学阻害剤は、分子レベルでその活性を制御するために、異なるメカニズムで機能する。PD98059とU0126はMEK1/2阻害剤として、ZNF462の活性に影響を与える下流の標的のリン酸化に重要なMAPK/ERK経路の活性化を阻止する。この経路を阻害することにより、PD98059とU0126は、ZNF462のERK依存性転写活性が抑制されないようにする。同様に、Raf-1キナーゼ阻害剤であるGW5074も、より早い段階でMAPK/ERKシグナル伝達カスケードを破壊し、ZNF462が遺伝子発現を効果的に制御するのに必要なリン酸化イベントを同様に減少させる。別の面では、JNKとp38 MAPKをそれぞれ阻害するSP600125とSB203580は、MAPキナーゼ経路の他の分枝を標的としており、ZNF462やその標的遺伝子と相互作用するタンパク質のリン酸化状態を変化させることによって、間接的にZNF462の調節に影響を与える可能性がある。
さらに、PI3K阻害剤であるLY294002とWortmanninは、翻訳後修飾を介して様々な転写因子を制御することが知られているPI3K/Akt経路活性の低下をもたらす。PI3K活性がない場合、細胞環境とZNF462の状態が変化し、その機能的活性が低下する可能性がある。同様に、PP2はSrcファミリーキナーゼを標的としており、その活性はリン酸化状態、ひいてはZNF462のような転写因子の活性に影響を与えうる。EGFRチロシンキナーゼ阻害剤であるPD168393は、ZNF462の制御機構と交差する可能性のあるEGFRシグナル伝達経路を阻害することができる。さらに、それぞれROCK1キナーゼとALK5の阻害剤であるY-27632とSB431542は、細胞骨格の配置やTGF-βシグナルなどの他のシグナル伝達経路に作用し、ZNF462の制御に下流から影響を及ぼす可能性がある。最後に、IKK-16によるIKKの阻害は、多くの制御ネットワークの上流にあるNF-κB経路に触れ、ZNF462による転写制御に影響を与える可能性がある。
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