ZNF219の化学的阻害剤は、その活性に不可欠な様々なシグナル伝達経路や酵素を標的とすることにより、その機能を制御する上で重要な役割を果たしている。スタウロスポリンは、ZNF219のリン酸化過程に必要なプロテインキナーゼを阻害することにより作用し、ZNF219の活性化と機能を直接阻害する。このキナーゼ阻害は、ZNF219がその活性に必要とするリン酸化を防ぐための重要なステップである。同様に、LY294002は、ZNF219が関与することが知られているAKTシグナル伝達経路の極めて重要な構成要素であるPI3Kを標的とし、その結果、機能的活性が阻害される。LY294002によるPI3Kの阻害は、通常ZNF219の機能活性に寄与するはずの下流のシグナル伝達を阻害する。もう一つの阻害剤であるラパマイシンは、ZNF219の調節機能を制御する経路の中心的キナーゼであるmTORシグナル伝達を阻害し、その活性を効果的に阻害する。トリシリビンはAKTを特異的に標的とし、それによってZNF219の通常のシグナル伝達経路への参加を阻止することにより、ZNF219の活性を低下させる。
さらに、SB203580とPD98059はともにMAPK経路の構成要素に対する選択的阻害剤として機能し、SB203580はp38 MAPKを標的とし、PD98059はMEKを阻害する。これらのキナーゼはどちらもZNF219が作用する経路の上流の制御因子であり、それらの阻害はZNF219の活性の低下をもたらす。U0126は、MAPK/ERK経路に不可欠なMEK1/2も阻害し、ZNF219を阻害する。SP600125は、ZNF219が関与するシグナル伝達経路の一部であるJNKを標的とし、その阻害はZNF219活性の低下に寄与する。LY294002のようなPI3K阻害剤であるWortmanninは、ZNF219が関与するシグナル伝達経路を破壊し、その細胞機能の阻害につながる。Bisindolylmaleimide I、Go 6983、Chelerythrineはすべて、ZNF219のリン酸化とそれに続く活性に必要なPKCを阻害する。これらの化合物によるPKCの阻害は、本質的なリン酸化事象を妨げることにより、ZNF219の活性を直接的に低下させる。
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