UBL4Aの機能に影響を与える阻害剤は、UBL4Aが複雑に関与するタンパク質の恒常性維持に不可欠な様々な細胞内プロセスを妨害するメカニズムで作用する。HSP90のような分子シャペロンの作用を阻害する化合物は、そのクライアントタンパク質の不安定化をもたらし、ミスフォールドした過剰なタンパク質でタンパク質の品質管理システムに負荷をかけることにより、間接的にUBL4Aの機能活性に影響を与える。同様に、プロテアソーム阻害剤は、分解を待つポリユビキチン化タンパク質の蓄積を引き起こし、間接的にUBL4A関連経路がこれらのタンパク質を効果的に管理する能力を脅かす。正常な細胞分裂の仕組みを阻害する阻害剤は、細胞周期が停止し、その中でタンパク質のフォールディングに対する要求が減少するため、有糸分裂におけるUBL4Aの役割の必要性を減少させることができる。
さらに、様々な段階でタンパク質の生合成を阻害する化合物(翻訳伸長を停止させるか、早期の鎖終結を引き起こすか)は、新生タンパク質の産生を減少させるため、UBL4Aのタンパク質フォールディング補助に対する機能的要求を低下させる。小胞体ストレスを誘導したり、小胞体関連分解を阻害する他の阻害剤は、小胞体内でミスフォールディングタンパク質を過剰に生成し、タンパク質の品質管理システムにさらなる負担をかけ、間接的にUBL4Aの活性を低下させる。細胞骨格成分や細胞内輸送機構の破壊もまた、UBL4Aが関連するタンパク質複合体の適切な局在と分布を妨げることにより、間接的にUBL4Aの機能に影響を与える。
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