TTC39C阻害剤は、現在の状況からすると、テトラトリコペプチドリピート(TPR)モチーフを含むタンパク質が役割を果たすと思われる経路や過程を主に標的としている。TPRモチーフはタンパク質間相互作用を媒介することが知られており、多様なタンパク質に存在する。幅広いキナーゼ阻害スペクトルを持つスタウロスポリンは、複数の細胞内経路に影響を与える可能性があり、それによってTTC39Cのようなタンパク質に影響を与える。
同様に、ラパマイシンやシクロスポリンAのような化合物は特定の標的を持つが、TPRモチーフを含むものを含む様々な細胞タンパク質に下流で影響を及ぼす可能性がある。クロロキンやMG-132のような阻害剤を用いて、エンドサイトーシス経路やタンパク質分解経路に注目することは、直接的あるいは間接的に、これらの経路を調節することで、その機能に影響を与える可能性のある別のアプローチを提供する。
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