TMTC3の化学的阻害剤は、TMTC3が関与するカルシウムシグナル伝達経路やイオン恒常性維持過程に影響を与える様々なメカニズムによって阻害効果を発揮する。Benzamilは、ENaCチャネルを選択的に遮断することにより、イオン勾配とカルシウムシグナル伝達を破壊し、それによって細胞内のイオン恒常性の変化に敏感なTMTC3の活性を阻害する。タプシガルギンは、SERCAポンプを標的とすることによりTMTC3の阻害に寄与し、細胞質カルシウムレベルを上昇させる。タプシガルギンによって引き起こされるカルシウム不均衡は、カルシウムホメオスタシスの影響を受けるTMTC3の機能を損なう可能性がある。PD98059は、TMTC3の制御に関与しうるERK/MAPK経路を阻害し、リン酸化事象の減少を通じてTMTC3活性の低下をもたらす。W-7塩酸塩はカルモジュリンに拮抗することにより機能し、TMTC3がカルシウム-カルモジュリン依存性の制御機構と相互作用する能力を阻害する。同様に、KN-93リン酸塩はCaMキナーゼIIを標的としており、その阻害はTMTC3の機能に必須なリン酸化事象を妨げ、その阻害につながる。
このテーマを続けると、ML-7塩酸塩は細胞骨格の動態に関与するミオシン軽鎖キナーゼ(MLCK)を阻害する;MLCKの阻害はTMTC3が適切に機能するために依存していると思われるこれらの動態を破壊する。カルシウムキレーターであるBAPTAは、細胞内カルシウムを隔離し、カルシウムの利用可能性を低下させることにより、TMTC3を阻害する。U73122は、ホスホリパーゼCを阻害することで、TMTC3のカルシウムを介する活性の制御に重要なIP3やジアシルグリセロールのようなセカンドメッセンジャーの産生を減少させる。IP3受容体の阻害剤であるゼストスポンジンCと2-APBは、TMTC3が関与するカルシウムシグナル伝達経路の中心である小胞体からのカルシウムの放出を阻害する。SKF-96365は、受容体を介するカルシウム侵入チャネルを阻害し、TMTC3が依存する細胞内カルシウム環境を変化させることにより、間接的にTMTC3の阻害につながる可能性がある。最後に、リアノジンはリアノジン受容体の機能を改変することによってカルシウムフラックスを破壊し、TMTC3の活性に必要なカルシウムホメオスタシスに不均衡を生じさせることによってTMTC3を阻害する可能性がある。これらの化学物質はそれぞれ、TMTC3が関与するカルシウムシグナル伝達とイオン恒常性を変化させることにより、TMTC3の機能を損なう。
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