フォルスコリンは細胞内のcAMPを増加させ、その結果プロテインキナーゼA(PKA)が活性化される。PKAは極めて重要なシグナル伝達分子であり、TMEM95関連経路のタンパク質を含む幅広いタンパク質をリン酸化する可能性がある。IBMXは、ホスホジエステラーゼの働きを阻害することでcAMPレベルを上昇させ、PKA活性を持続させる。PMAはプロテインキナーゼC(PKC)を活性化し、様々なタンパク質のセリン残基やスレオニン残基をリン酸化し、TMEM95複合体に影響を与える可能性がある。対照的に、プロテインホスファターゼ1および2Aの強力な阻害剤であるオカダ酸や、幅広いキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、細胞内のリン酸化バランスを操作し、TMEM95活性を制御する可能性のあるタンパク質に影響を与える。
U73122は、ホスホリパーゼCを阻害することにより、TMEM95の機能を変化させる可能性のある数多くのタンパク質や細胞プロセスの制御に重要な役割を果たすカルシウムシグナル伝達経路の下流を阻害する。W-7塩酸塩とKN-93は、それぞれカルモジュリンに拮抗し、Ca2+/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼIIを阻害することにより、TMEM95の活性を含むタンパク質の機能を調節するカルシウムシグナルの重要性を強調している。チロシンキナーゼ阻害剤であるゲニステインは、リン酸化カスケードを変化させることによってTMEM95に影響を与える可能性があり、ホスファチジルイノシトール3-キナーゼとMEK1/2をそれぞれ阻害するLY294002とPD98059は、TMEM95シグナル伝達と交わる可能性のある細胞の生存と分化に重要な経路を標的としている。もう一つのPKC阻害剤であるGö 6983は、細胞内のリン酸化状態を複雑に制御し、TMEM95に関連するタンパク質に連鎖的な影響を及ぼす可能性があることを示している。
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