TIP41の化学的阻害剤は、TIP41の機能的活性に寄与する主要なシグナル伝達経路を阻害することにより、阻害効果を発揮することができる。強力なキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、TIP41をリン酸化することで知られるPKAのようなプロテインキナーゼの活性を抑制し、細胞内でのTIP41の活性を低下させることができる。同様に、Bisindolylmaleimide Iは、リン酸化プロセスを通じてTIP41の活性に影響を与えるもう一つのキナーゼであるPKCを標的とする。したがって、Bisindolylmaleimide IによるPKCの阻害は、TIP41のリン酸化とそれに続く活性の低下をもたらす。
PI3K/ACT/mTORシグナル伝達経路はTIP41のもう一つの重要な制御因子であり、このカスケードを標的とするいくつかの阻害剤がTIP41を阻害する。LY294002とWortmanninはどちらもPI3Kの阻害剤であり、AKT活性を低下させ、TIP41をリン酸化することが知られているキナーゼであるmTOR活性を下流で低下させる。このmTOR活性の低下は、TIP41のリン酸化と活性の低下に直結する。ラパマイシンはmTORを特異的に阻害し、TIP41のリン酸化を抑制してその機能を阻害する化合物のもう一つの例である。同様に、PP242とTorin 1は選択的mTOR阻害剤であり、TIP41のリン酸化と活性化に必要なmTORのキナーゼ活性を阻害する。AZD8055は、この阻害作用をmTORC1とmTORC2複合体の両方に拡大し、TIP41のリン酸化と活性を包括的に低下させる。Palomid 529もAKT/mTOR経路を阻害し、TIP41のリン酸化と活性を低下させる。PF-4708671は、mTORの下流エフェクターであるS6K1を特異的に阻害し、S6K1はTIP41をリン酸化して活性化する。S6K1を阻害することにより、PF-4708671はTIP41の活性を低下させる。WYE-354とKu-0063794も同様に、TIP41のリン酸化に必要なmTORを阻害し、TIP41の活性を全体的に低下させる。
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