SWI5の化学的阻害剤には、タンパク質の機能にとって重要な様々な細胞内プロセスを阻害する様々な化合物が含まれる。トリコスタチンAはヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であり、SWI5と相互作用する制御タンパク質をコードする遺伝子を含む遺伝子の転写の前提条件であるクロマチンリモデリングに不可欠なアセチル化プロセスを阻害する。この作用により、トリコスタチンAは、これらの制御タンパク質の発現を阻害することで、SWI5の機能阻害につながる。チェトミンは、クロマチンリモデリングプロセスを阻害することにより、低酸素誘導因子とコアクチベーターp300/CBPの相互作用を阻害し、SWI5の適切な機能に必要なタンパク質の発現を低下させることができる。SERCA阻害剤であるシクロピアゾン酸はカルシウムのホメオスタシスを変化させ、SWI5の活性化に必要なシグナル伝達経路を阻害する可能性がある。ミトキサントロンとカンプトテシンは、それぞれDNA複製とトポイソメラーゼ酵素を阻害することにより、SWI5と相互作用するタンパク質をコードする遺伝子の転写を阻害し、SWI5の機能を直接阻害する。
さらに、もう一つのトポイソメラーゼII阻害剤であるエトポシドはDNA損傷を誘発し、SWI5の機能に必要な遺伝子の転写を阻害することができる。ロカグラミドは、翻訳開始複合体のeIF4A成分に結合することにより、SWI5の機能に必須なタンパク質の合成を減少させ、翻訳を阻害することができる。ラパマイシンと17-AAG(タネスピマイシン)はそれぞれmTORとHsp90シャペロン活性を阻害する。ラパマイシンによるmTORの阻害はSWI5と相互作用するタンパク質を制御し、17-AAGによるHsp90の阻害はそのようなタンパク質の適切なフォールディングを妨げ、両者ともSWI5の機能阻害につながる。ゲルダナマイシンは17-AAGと同様にHsp90に結合し、SWI5と相互作用する制御タンパク質の成熟を阻害する。最後に、p38 MAPキナーゼの阻害剤であるPD169316とSB203580は、SWI5の機能に必須なタンパク質のリン酸化を阻害し、SWI5の阻害につながる。
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