SMPDL3Aの化学的活性化物質には、様々な生化学的機序によってその活性を増強することができる様々な化合物が含まれる。例えば、スフィンゴシン-1-リン酸は生物学的に活性な脂質であり、SMPDL3Aによって脱リン酸化され、その結果、S1Pの局所濃度が上昇し、SMPDL3Aの活性化が促進される。同様に、スフィンゴシンアナログであるFTY720は、リン酸化されるとFTY720-リン酸を形成するが、これはS1Pを模倣している可能性があり、SMPDL3Aの基質としても機能するため、SMPDL3Aの活性を促進する。さらに、フォルスコリンは、細胞内のcAMPレベルを上昇させることにより、プロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。PKAの活性化は、SMPDL3Aまたはそれに関連するタンパク質を含むタンパク質のリン酸化を引き起こし、その結果、SMPDL3Aが活性化される。cAMPの合成アナログであるジブチリル-cAMPもまた、細胞を透過してPKAを活性化し、同様のリン酸化メカニズムによってSMPDL3Aの活性化につながる可能性がある。
フォルボール12-ミリスチン酸13-アセテート(PMA)、ブリオスタチン1、1,2-ジオクタノイル-sn-グリセロール(DiC8)などのプロテインキナーゼC(PKC)活性化因子はすべて、SMPDL3Aのリン酸化とそれに続く活性化をもたらすカスケードを開始することができる。PKCは活性化されると、SMPDL3Aを含む様々な基質をリン酸化する。イオノマイシンのような薬剤による細胞内カルシウムの増加は、カルシウム依存性プロテインキナーゼを活性化し、それが直接SMPDL3Aをリン酸化し、活性化につながる可能性がある。タプシガルギンは、SERCAポンプを阻害することにより、細胞質カルシウム濃度の上昇をもたらし、同様にSMPDL3Aをリン酸化するキナーゼを活性化する可能性がある。さらに、プロテインホスファターゼの阻害剤であるカリンクリンAとオカダ酸は、SMPDL3Aをリン酸化状態に維持し、活性を維持することができる。最後に、アニソマイシンがストレス活性化プロテインキナーゼを活性化することは、SMPDL3A活性化のもう一つの可能性を示している。これらのキナーゼは、細胞ストレス応答の一部としてSMPDL3Aをリン酸化し活性化することができるからである。これらの化学物質はそれぞれ、SMPDL3Aのリン酸化状態と活性に収束しうる細胞内シグナル伝達経路において役割を果たしている。
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