SMIM23の活性化機構は複雑で、特定の活性化因子の影響を受ける様々な生化学的経路が関与している。そのようなメカニズムのひとつに、アデニル酸シクラーゼの直接刺激による細胞内cAMPの上昇があり、これがプロテインキナーゼA(PKA)の活性化を頂点とする一連の事象を引き起こす。一旦活性化されると、PKAは様々な標的タンパク質をリン酸化し、SMIM23の活性増強につながる可能性がある。さらに、様々な生化学的薬剤によってプロテインキナーゼC(PKC)が活性化されると、SMIM23の機能的能力に影響を及ぼす可能性のあるタンパク質がリン酸化される。シグナル伝達カスケードにおける役割で知られるPKCは、SMIM23と密接に相互作用する、あるいはSMIM23の機能を制御する主要タンパク質の活性を修飾することができる。この相互作用は、あるシグナル伝達分子の調節がSMIM23の活性に下流でどのような影響を及ぼすかを例証している。
さらに、細胞内のカルシウムレベルは、SMIM23活性の制御におけるもう一つの重要な因子である。ある種の化合物はカルシウムイオノフォアとして作用し、カルシウムイオンの細胞質濃度を上昇させ、その結果、カルシウム依存性タンパク質やSMIM23に関連するプロセスの活性を調節する可能性がある。これには、カルシウム依存性キナーゼやホスファターゼの活性化によるSMIM23の機能促進も含まれる。活性酸素種によって誘導される酸化ストレスもまた、細胞内シグナル伝達経路を変調させる可能性があり、SMIM23の活性に影響を及ぼすかもしれない。
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