Sec24Bの化学的阻害剤は、このタンパク質が関与する細胞内経路に影響を与える様々なメカニズムによって阻害効果を発揮する。Exo1はCOPII複合体形成の開始に不可欠なGTPaseであるSar1を阻害し、小胞の出芽におけるSec24Bの役割は、この複合体が適切に機能することに依存している。したがって、Exo1がSar1を阻害すると、間接的にSec24Bが輸送のために荷物の選択に参加する能力を阻害することになる。同様に、H89はプロテインキナーゼAやその他の関連キナーゼを標的としており、Sec24Bを制御したり相互作用したりするタンパク質のリン酸化状況を変化させる可能性がある。この変化は、小胞形成におけるSec24Bの機能障害につながる可能性がある。ブレフェルジンAは、小胞輸送に必要なGTPaseであるADPリボシル化因子を標的として、ゴルジ装置を破壊する。この破壊は、小胞輸送におけるその役割のために機能的なゴルジ体に依存しているSec24Bに下流の影響を及ぼす。
さらに、ML9によるミオシン軽鎖キナーゼの阻害は、Sec24Bの小胞輸送能力に影響を与える細胞骨格の変化をもたらす。Gö6976は、特定のプロテインキナーゼCアイソフォームを選択的に阻害することにより、小胞輸送に関与するタンパク質のリン酸化状態を変化させ、Sec24Bの機能を間接的に阻害する。Wortmanninは、ホスホイノシチド3-キナーゼを阻害することにより、Sec24Bが関与する小胞形成に必要なホスホイノシチドの産生に影響を与える。ダイナソアはダイナミンGTPase活性を標的とし、ゴルジ体からの小胞の脱離を阻害し、結果としてSec24Bを含むCOPII小胞の放出を妨げる。さらに、ラトルンクリンAとジャスプラキノライドは、小胞輸送におけるSec24Bの機能にとって重要である正常なアクチンダイナミクスを破壊する。ラトルンクリンAはアクチン重合を阻害することにより、ジャスプラキノライドはアクチンフィラメントを安定化することにより、小胞輸送を阻害する。CK-636は、アクチンの核形成を担うArp2/3複合体を標的とすることでSec24Bを阻害し、小胞の形成と移動におけるSec24Bの役割に不可欠である。ピットストップ2はクラスリンを介するエンドサイトーシスを阻害し、これは間接的にSec24Bの荷物の選別と輸送の機能に影響を与える可能性がある。最後に、YM-201636によるホスファチジルイノシトール4-キナーゼIIIβの阻害は、小胞を介した輸送を指揮する脂質であるPI4Pの生成に影響を与え、それによって小胞形成へのSec24Bの参加を間接的に阻害する。
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