SCML1アクチベーターは、主にクロマチンリモデリング過程への影響を通じて機能する。SCML1はポリコームグループ(PcG)複合体の一部として機能しており、クロマチンリモデリングを通じて転写抑制に直接関与している。この複合体はクロマチン構造を改変することでその機能を発揮し、クロマチン状態の変化はSCML1の活性に直接影響を与える。例えば、トリコスタチンA、スベラニルヒドロキサム酸(SAHA)、スクリプタイド、オキサムフラチン、MS-275、MC1568、酪酸ナトリウムはすべてヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であり、ヒストンのアセチル化を促進し、SCML1の機能的活性を高めることができる弛緩したクロマチン状態に導く。同様に、G9aヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤であるBIX-01294は、ヒストンのメチル化を減少させ、クロマチンリモデリングを促進し、結果としてSCML1の機能的活性を増強する。
5-アザシチジン、5-アザ-2'-デオキシシチジン、RG108を含むSCML1活性化因子の第二のグループは、DNAメチル化酵素阻害剤である。これらの化合物は、クロマチンリモデリングのもう一つの形態であるDNAの脱メチル化を引き起こし、SCML1の機能的活性を高めることができる。DNA結合抗生物質であるミトラマイシンAもSCML1の活性化剤である。転写因子のDNAへの結合を阻害することにより、遺伝子発現を変化させ、間接的にSCML1を活性化することができる。
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