SAMD1の化学的阻害剤は、様々な細胞内シグナル伝達経路を通じてその活性を調節することができる。パルボシクリブは、CDK4/6を阻害することにより、SAMD1が関与するG1-S転移における細胞周期の進行を制限し、細胞周期調節におけるSAMD1の役割に影響を与える。同様に、MEK阻害剤であるPD0325901とU0126は、細胞の分化と増殖におけるSAMD1の機能にとって重要なMAPK/ERK経路を阻害することができる。この阻害により、SAMD1が関与する下流のシグナル伝達が阻害される。SP600125とSB203580は、それぞれJNKとp38 MAPKというMAPK経路内の異なるキナーゼを標的とする。これらのキナーゼを阻害することで、SAMD1が活性を示すシグナル伝達カスケードを破壊し、ストレス応答、アポトーシス、炎症、サイトカイン産生に関連するSAMD1の活性を低下させることができる。
さらに、PI3K阻害剤であるLY294002とWortmanninは、PI3K/ACT経路を阻害することによってSAMD1に影響を与え、その結果、細胞の生存や増殖などのプロセスに影響を与える。mTOR阻害剤であるラパマイシンもまた、PI3K/ACT/mTOR経路を阻害することで、細胞の代謝と増殖におけるSAMD1の役割に影響を与える。ダサチニブによるSrcファミリーキナーゼの阻害は、SAMD1に関連したシグナル伝達と細胞増殖の制御を低下させる可能性がある。さらに、Rafキナーゼ阻害剤であるGW5074は、上流のMAPK/ERK経路を破壊し、SAMD1の機能的活性を阻害することができる。最後に、Y-27632とZM-447439は、それぞれROCKキナーゼ阻害剤とオーロラキナーゼ阻害剤であるが、SAMD1の活性を変化させることができる。Y-27632はアクチン細胞骨格の構成に影響を与え、ZM-447439は有糸分裂中の染色体の整列と分離を阻害する。
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