RNase HII-C活性化剤は、ゲノムの安定性を維持するために重要なRNA-DNAハイブリッドの除去に関与するタンパク質であるRNaseH2Cとしても知られるRNase HII-Cの活性に間接的に影響を与える化学物質と理解することができる。これらの化合物は一般に、複製ストレスやDNA損傷を引き起こすことによって機能し、それによってRNA-DNAハイブリッドの形成を増加させ、RNASEH2Cはその解消に関与する。例えば、ヒドロキシ尿素とアフィジコリンは複製ストレスを引き起こし、それによってRNA-DNAハイブリッドの増加をもたらす。同様に、5-フルオロウラシル、ゲムシタビン、アジドチミジン、テノホビル、フルダラビンはDNAに取り込まれることにより、DNA構造の破壊と複製ストレスを引き起こし、RNA-DNAハイブリッドの形成を増加させる可能性がある。
さらに、メトトレキサートは葉酸代謝を阻害することにより、dNTPプールの不均衡を引き起こし、RNA-DNAハイブリッド形成を増加させる可能性がある。同様に、エトポシド、シスプラチン、ドキソルビシン、カンプトテシンもDNA損傷を引き起こすことにより、RNA-DNAハイブリッド形成を増加させる可能性がある。従って、これらの化学物質はいずれもRNASEH2Cを直接活性化しないが、RNASEH2Cが分解に関与するRNA-DNAハイブリッドの形成を増加させることにより、間接的にその活性に影響を与える可能性がある。
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