PRAMEF15活性化剤は、PRAMEF15遺伝子によってコードされるタンパク質であるPRAMEファミリーメンバー15の活性を増強するように特別に設計された化学的分子群を指す。PRAME (Preferentially Expressed Antigen in Melanoma)ファミリーのメンバーは、遺伝子発現の制御における役割によって特徴付けられ、典型的には、クロマチン構造とダイナミクスを調節する大きなタンパク質複合体の一部として機能する。このファミリーのタンパク質は、タンパク質-タンパク質相互作用を促進するドメインを含むことが多く、これはこれらの複合体への取り込みと遺伝子制御における機能にとって重要である。したがって、PRAMEF15の活性化因子は、タンパク質の活性コンフォメーションを安定化させたり、他のタンパク質やDNAとの相互作用能力を高めたり、あるいは細胞内での発現量を増加させたりすることによって、タンパク質の制御活性を高める化合物となる可能性がある。このような活性化因子を発見するには、タンパク質の構造と遺伝子制御における役割の根底にある分子メカニズムに関する詳細な知識が必要である。
PRAMEF15活性化因子の探索では、通常、多面的なアプローチが行われる。最初に、PRAMEF15の活性を測定するためのアッセイ系を開発する必要があるが、これには、タンパク質が特定の標的遺伝子を制御することが知られている場合には、遺伝子発現のレポーターアッセイや、他のタンパク質パートナーやDNAとの結合を検出する生化学的アッセイが含まれる。その後、ハイスループット・スクリーニング(HTS)を用いて、PRAMEF15の活性を増加させる能力があるかどうか、小分子の大規模なライブラリーをテストすることができる。これらの初期スクリーニングで有望な化合物は、その特異性を確認し、標的外効果を除外するために、さらなる検証を受けることになる。これには、活性化因子の選択性を確認するために、関連するPRAMEファミリータンパク質や他の遺伝子制御因子を用いた二次的なアッセイが含まれるかもしれない。潜在的な活性化因子が同定されたら、それらがPRAMEF15の機能を増強するメカニズムを理解するために、綿密な生化学的研究が必要であろう。活性化因子がPRAMEF15とそのタンパク質パートナーとの相互作用に与える影響を評価するためには、共免疫沈降法などの技術を用いることができ、一方、クロマチン免疫沈降(ChIP)アッセイは、タンパク質がクロマチンと会合する能力の変化を解明するのに役立つであろう。PRAMEF15活性化因子の同定と特性解析は、このタンパク質の分子機能と遺伝子制御の複雑なネットワークにおける役割の理解に大きく貢献するだろう。
関連項目
製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
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5-Azacytidine | 320-67-2 | sc-221003 | 500 mg | $280.00 | 4 | |
DNAを脱メチル化し、PRAMEF15と推定される遺伝子を含む、がん細胞でエピジェネティックにサイレンシングされた遺伝子の発現につながる可能性がある。 | ||||||
Disulfiram | 97-77-8 | sc-205654 sc-205654A | 50 g 100 g | $52.00 $87.00 | 7 | |
プロテアーゼ活性を変化させ、タンパク質の分解に影響を与え、特定の抗原の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Resveratrol | 501-36-0 | sc-200808 sc-200808A sc-200808B | 100 mg 500 mg 5 g | $60.00 $185.00 $365.00 | 64 | |
エピジェネティックなメカニズムによって遺伝子発現に影響を与えることが知られており、これは仮にPRAMEファミリーに影響を与える可能性がある。 | ||||||
Levamisole Hydrochloride | 16595-80-5 | sc-205730 sc-205730A | 5 g 10 g | $42.00 $67.00 | 18 | |
免疫機能を調節し、PRAMEファミリー遺伝子を含む免疫応答性遺伝子の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Sodium Butyrate | 156-54-7 | sc-202341 sc-202341B sc-202341A sc-202341C | 250 mg 5 g 25 g 500 g | $30.00 $46.00 $82.00 $218.00 | 18 | |
HDAC阻害剤であり、ヒストンの過剰アセチル化を引き起こし、PRAMEファミリー遺伝子を含む遺伝子発現に影響を及ぼす可能性がある。 | ||||||
Methotrexate | 59-05-2 | sc-3507 sc-3507A | 100 mg 500 mg | $92.00 $209.00 | 33 | |
ストレス反応を誘導し、遺伝子発現パターンを変化させる可能性があり、癌胎児性抗原の発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||
Oxaliplatin | 61825-94-3 | sc-202270 sc-202270A | 5 mg 25 mg | $110.00 $386.00 | 8 | |
化学療法剤として、DNA修復機構に影響を与え、遺伝子発現プロファイルに影響を与える可能性がある。 | ||||||
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | 67-68-5 | sc-202581 sc-202581A sc-202581B | 100 ml 500 ml 4 L | $30.00 $115.00 $900.00 | 136 | |
溶媒として使用されることが多いが、ある種の細胞状況では分化や遺伝子発現を調節することもある。 | ||||||
Curcumin | 458-37-7 | sc-200509 sc-200509A sc-200509B sc-200509C sc-200509D sc-200509F sc-200509E | 1 g 5 g 25 g 100 g 250 g 1 kg 2.5 kg | $36.00 $68.00 $107.00 $214.00 $234.00 $862.00 $1968.00 | 47 | |
遺伝子発現の調節を含む多様な生物学的作用があり、PRAMEファミリー遺伝子に影響を与える可能性がある。 |