POLR2D阻害剤

一般的なPOLR2D阻害剤としては、α-Amanitin CAS 23109-05-9、Triptolide CAS 38748-32-2、DRB CAS 53-85-0、Actinomycin D CAS 50-76-0およびCordycepin CAS 73-03-0が挙げられるが、これらに限定されない。

RNAポリメラーゼII（Pol II）のサブユニットPOLR2Dの化学的阻害剤は、様々なメカニズムで転写プロセスを阻害する。例えばα-アマニチンは、Pol IIに結合して酵素がDNAをメッセンジャーRNA（mRNA）に転写するのを阻害することにより、Pol IIを直接標的とする。この結合は非常に特異的で、酵素の活性を強力に阻害する。.α-アマニチンの作用は、POLR2DがPol II複合体に不可欠であることから、POLR2Dサブユニットの機能に大きな影響を与えることを示す。一方、トリプトライドは、転写開始に重要な転写因子IIH（TFIIH）複合体のXPBサブユニットに共有結合することによって、転写機構を妨害する。この結合は、転写開始複合体のアセンブリと安定性を破壊し、Pol IIの転写活性を阻害する。

DRB、アクチノマイシンD、コルディセピンなどの他の化合物は、さらにユニークな作用機序を示す。DRBは、転写産物の伸長に不可欠なPol II最大サブユニットのC末端ドメイン（CTD）のリン酸化を阻害することによって作用する。これはポリメラーゼのDNAに沿った進行を停止させることにより、POLR2Dに影響を与える。アクチノマイシンDは、転写開始複合体のDNAにインターカレートすることによって阻害効果を発揮し、それによってRNAポリメラーゼIIによる転写の伸長期を阻止する。ヌクレオシドアナログであるコルジセピンは、伸長中のRNA鎖に取り込まれることによってmRNA鎖の伸長を停止させる。これは転写プロセスの早期停止につながり、間接的にPOLR2Dの役割に影響を与える。最後に、Tagetitoxinは転写開始複合体に結合して安定化させ、転写過程におけるPOLR2Dの活性に不可欠な伸長期への移行を妨げる。これらの阻害剤はそれぞれ、POLR2Dサブユニットまたは関連複合体との明確な相互作用を通して、RNAポリメラーゼIIが行う転写の全体的なプロセスを効果的に阻害する。