ORP-3の化学的阻害剤は、主にその脂質相互作用と転移活性を阻害することによって、タンパク質の機能の様々な側面を標的とする。例えば、GW4869はスフィンゴミエリナーゼを阻害し、セラミドレベルを低下させる。セラミドはORP-3が相互作用する脂質であり、その利用可能性の低下はORP-3の脂質転移機能を阻害する可能性がある。同様に、U18666Aは細胞内のコレステロール輸送を阻害し、それによってORP-3の活性に重要なコレステロールとの相互作用を阻害する。フィリピンもコレステロールを標的とするが、コレステロール分子に直接結合することによって、ORP-3からコレステロールを隔離し、このタンパク質がこの必須脂質を輸送する能力を阻害する。ゴシポールが様々な酵素を阻害することで、ORP-3の機能にとって不可欠な脂質シグナル伝達経路が破壊される可能性がある。
脂質代謝に対するプロゲステロンの影響は、細胞膜の脂質組成を変化させることによってORP-3を阻害し、ORP-3の脂質基質へのアクセスに影響を与える可能性がある。PD98059によるMEKの阻害は、その機能に必要な必須シグナル伝達経路へのORP-3の参加を減少させる可能性がある。WortmanninとLY294002はともに、ORP-3が関与するPI3K/Akt経路の上流にあるホスホイノシチド3-キナーゼ(PI3K)を阻害する。これらの化学物質によるこの経路の阻害は、タンパク質の活性を低下させる可能性がある。最後に、シンバスタチン、YM-53601、プラバスタチンなどのスタチンは、コレステロールの生合成に重要な酵素であるHMG-CoA還元酵素を阻害する。コレステロールの合成を減少させることにより、これらのスタチンは、ORP-3が移動するためのコレステロールの利用可能性を減少させることにより、ORP-3を阻害することができる。
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