OR51S1は様々な分子間相互作用を通して機能し、それぞれがこのGタンパク質共役型受容体(GPCR)の活性化をもたらす明確なシグナル伝達カスケードを開始する。ベンズアルデヒドは、受容体の結合部位にドッキングすることでOR51S1と結合し、細胞内カルシウムレベルの上昇を特徴とするシグナル伝達を引き起こす構造的再構成を引き起こす。ユーカリプトールとゲラニオールも同様のパターンで、それぞれの分子がOR51S1の結合ポケットに正確にはまり、関連するGタンパク質の活性化を促進し、シグナル伝達カスケードを開始する。シトロネラール、フェネチルアルコール、酢酸イソアミルもOR51S1アゴニストとして作用し、それぞれ受容体の匂い物質結合領域に結合し、下流のGタンパク質経路の活性化につながり、それに続いてOR51S1の活性化が起こる。
アニスアルデヒド、サリチル酸メチル、シンナムアルデヒドは、受容体のリガンド特異的ドメインに結合することでOR51S1を活性化し、Gタンパク質が関与する一連の細胞内イベントを引き起こす。その結果、受容体のコンフォメーションが変化し、OR51S1が活性化される。同様に、メントール、エチルバニリン、リモネンはOR51S1の活性化剤として機能し、各化合物は受容体のリガンド結合ドメインに関与し、Gタンパク質の活性化を介したシグナル伝達経路を開始し、OR51S1の機能的活性化に至る。これらの分子間相互作用は、様々な化学物質が、直接結合とそれに続くGタンパク質を介したシグナル伝達経路を通して、OR51S1の活性化を開始することができる、多様でありながら特異的な方法を示している。
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