NUDT22阻害剤には、プリン代謝とヌクレオチド合成の異なる段階に作用する様々な化合物が含まれる。これらの阻害剤はNUDT22を直接標的とするのではなく、むしろその基質の利用可能性を減少させたり、競合阻害剤の濃度を上昇させたりすることで、NUDT22の機能を間接的に阻害する。例えば、アロプリノールとメトトレキサートはプリンヌクレオチド合成の上流にある酵素を標的とするため、NUDT22活性に必要な基質のレベルが変化する可能性がある。具体的には、メトトレキサートによるプリン合成経路の阻害は、NUDT22が処理できるヌクレオチドのレベルを著しく低下させる可能性がある。
同様に、メルカプトプリンやミコフェノール酸のような化合物は、プリンヌクレオチドの合成と代謝を阻害する。そうすることで、NUDT22の基質濃度を低下させるだけでなく、ヌクレオチドアナログの濃度を上昇させ、NUDT22の酵素機能を競合的に阻害する可能性がある。メルカプトプリンは代謝拮抗物質として作用し、DNAやRNAに取り込まれ、プリンヌクレオチド合成を阻害する。NUDT22は酸化プリンヌクレオシド二リン酸を加水分解することでヌクレオチドプールの維持に関与しているため、メルカプトプリンの存在はこれらの基質の蓄積につながり、基質過剰あるいは競合阻害によりNUDT22の機能を阻害する可能性がある。
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