数多くの細胞内プロセスに関与するタンパク質であるNHSL2の調節は、様々なシグナル伝達経路の編成によって達成される。特定の化合物によるアデニル酸シクラーゼの活性化はcAMPレベルの上昇につながり、次にプロテインキナーゼA(PKA)を活性化する。PKAの活性化はリン酸化カスケードを開始し、直接あるいは間接的にNHSL2の機能的活性化につながる。このカスケードは、細胞制御機構を迂回する安定なcAMPアナログの使用によってさらに増強され、PKAシグナルを長時間持続させ、NHSL2活性に影響を与える。さらに、ジアシルグリセロールを模倣する化合物によってPKCが活性化されると、このキナーゼはNHSL2やその関連制御タンパク質の活性を調節し、結果としてNHSL2の機能を増強することができる。
キナーゼ駆動経路とは別に、細胞内カルシウム濃度はNHSL2活性に極めて重要な役割を果たしている。細胞内カルシウム濃度を上昇させる化合物は、カルモジュリン依存性キナーゼを含む様々なカルシウム依存性シグナル伝達分子を活性化し、NHSL2の活性化につながると考えられる。ある種の阻害剤によるホスファターゼやGSK-3βの阻害もまた、NHSL2と相互作用するシグナル伝達タンパク質の活性化につながり、それによってNHSL2の活性化状態に影響を与える。一方、ホスホジエステラーゼ酵素を阻害すると環状ヌクレオチドが蓄積し、PKAのようなキナーゼがさらに活性化され、NHSL2活性が上昇する可能性がある。
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