MRP-L36の活性化因子は、特にミトコンドリアの生合成とエネルギー代謝に関連して、タンパク質の機能的活性を高めるために様々な分子メカニズムに関与している。例えば、ある種の活性化因子は、アデニル酸シクラーゼを直接、あるいは受容体を介したシグナル伝達によって標的とし、細胞内のcAMPレベルを上昇させる。このcAMPの上昇は、ミトコンドリアの生合成に関与するタンパク質をリン酸化する重要な調節因子であるプロテインキナーゼAの活性化を引き起こす。その結果、このシグナル伝達カスケードは、MRP-L36のようなミトコンドリアリボソームタンパク質を含むミトコンドリアタンパク質の産生を増大させ、ミトコンドリアの翻訳能力に対する需要の増大をサポートする。他の活性化因子は、細胞のエネルギー恒常性における役割で知られるAMP活性化プロテインキナーゼ経路を調節することによって働く。このキナーゼを刺激することによって、これらの活性化因子はミトコンドリア生合成のアップレギュレーションを促進し、それによって間接的にミトコンドリア成分の合成を促進する。
あるいは、活性化因子の中には、SIRT1やPPAR-γのような代謝調節因子と相互作用することによって影響を及ぼすものもある。これらの相互作用の結果、ミトコンドリア生合成の増加を制御するマスターレギュレーターであるPGC-1αが脱アセチル化され、活性化される。その結果、ミトコンドリアタンパク質の産生が亢進し、ミトコンドリアタンパク質の合成に不可欠なMRP-L36が暗黙のうちに含まれている。さらに、ある種の小分子による細胞内pHとエネルギー代謝の変化は、間接的にミトコンドリアリボソームタンパク質の活性の増加を必要とすることがある。これらの分子は、ミトコンドリア機能に影響を与える代謝的変化を引き起こし、その結果、ミトコンドリアと関連するリボソーム機構の生合成を刺激する可能性がある。この適応反応により、細胞の生体エネルギーの必要性が満たされ、MRP-L36が不可欠であるミトコンドリアのリボソームが適切に機能するようになる。
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