MNS1の化学的阻害剤は、様々な細胞的・分子的メカニズムによってその効果を発揮する。コルヒチンは微小管の重合を阻害することで知られているが、微小管の動態に依存することが多いMNS1の適切な細胞内局在を阻害することにより、MNS1を阻害することができる。同様に、パクリタキセル(タキソール)は微小管を安定化させることにより、タンパク質の機能が微小管の脱重合に依存している場合、MNS1を阻害することができる。アクチンフィラメントとモノマーをそれぞれ阻害するサイトカラシンDとラトルンクリンAによって証明されるように、細胞骨格構造の破壊はMNS1の阻害における共通のテーマである。このような干渉は、アクチン依存性の輸送やその活性に重要な構造経路を阻害することによってMNS1を阻害することができる。ブレビスタチンとML-7は、それぞれミオシンII ATPアーゼとミオシン軽鎖キナーゼを標的とすることで、このテーマにさらに貢献し、MNS1の局在と機能に必要なミオシンベースの輸送過程を阻害することでMNS1を阻害することができる。
細胞骨格の破壊に加えて、ミトマイシンCのような阻害剤は、細胞周期の停止につながるDNA損傷応答を引き起こすことにより、MNS1を間接的に阻害することができる。ブレフェルジンAとモネンシンはゴルジ体の機能を破壊し、MNS1の機能にとって重要な翻訳後修飾と輸送を阻害することにより、MNS1を阻害することができる。細胞内シグナル伝達経路を標的とするWortmanninはPI3Kを阻害し、MNS1の活性または安定性を制御するシグナル伝達経路を阻害する。ラパマイシンは、タンパク質合成と細胞増殖の中心的調節因子であるmTORを阻害し、MNS1の機能的役割を包含する全体的なタンパク質産生と細胞増殖経路に影響を与えることにより、MNS1を阻害することができる。
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