ここで述べるMCM6阻害剤は、DNA複製と修復の様々な段階を標的とし、MCM6タンパク質の機能に間接的に影響を与える様々な化学薬剤を包含する。これらの阻害剤には、ヌクレオシドアナログ、DNA合成阻害剤、DNA損傷を誘発する薬剤が含まれ、それぞれがMCM6がその一部であるMCM複合体の正常な機能を阻害する役割を担っている。ゲムシタビンやフルダラビンのようなヌクレオシドアナログは、複製中にDNAに取り込まれ、連鎖終結を引き起こし、結果として複製プロセスを阻害する。このメカニズムは、MCM複合体が極めて重要な役割を果たしている複製フォークの進行を阻害するため、間接的にMCM複合体に影響を与える。同様に、ヒドロキシ尿素や5-フルオロウラシルのような阻害剤は、DNA合成に必要なヌクレオチドの利用可能性を低下させ、間接的にMCM複合体の活性に影響を与える。
一方、シスプラチンやカンプトテシンなどの薬剤はDNA損傷を誘発する。シスプラチンはDNA架橋を形成し、カンプトテシンはトポイソメラーゼIを阻害し、複製中のDNAスーパーコイルの弛緩を妨げる。これらの形態のDNA損傷は複製フォークを停止させ、複製のためにDNAらせんをほどくMCM複合体の機能に間接的に影響を与える。もう一つのトポイソメラーゼ阻害剤であるが、トポイソメラーゼIIを標的とするエトポシドは、DNA鎖切断を誘発し、複製ストレスをさらに助長する。さらに、パルボシクリブやボルテゾミブのような化合物は細胞周期の進行を阻害する。CDK4/6阻害剤であるパルボシクリブは、細胞をG1期で停止させ、MCM複合体が重要な役割を果たすDNA複製の開始を妨げる。プロテアソーム阻害剤であるボルテゾミブは、細胞周期の停止を引き起こし、DNA複製と修復に関与するタンパク質の制御を阻害する可能性がある。
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