LOC665622の化学的阻害剤は、クロマチンリモデリングにおけるLOC665622の重要な役割であるDNAとの相互作用を阻害することによって機能する。これらの阻害剤、主にヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)阻害剤は、ヒストンタンパク質のアセチル化レベルの上昇をもたらす。トリコスタチンA、モセチノスタット、エンチノスタット、パノビノスタット、ロミデプシン、ボリノスタット、ベリノスタット、チダミド、キシノスタット、ジビノスタットなどの化合物は、すべてHDACを阻害することによって機能する。HDACが阻害されると、クロマチン構造がよりコンパクトになり、LOC665622のようなクロマチン関連タンパク質とDNAの結合親和性が低下する。その結果、LOC665622の機能は阻害される。LOC665622はその効果を発揮するためにクロマチンへの結合能力に依存しているからである。
さらに、阻害剤バルプロ酸はヒストンのアセチル化を増加させ、LOC665622のDNA結合特性を阻害しうる弛緩したクロマチン状態に導く。同様に、合成ベンズアミド誘導体であるタセジナリンはHDACを阻害し、クロマチン構造を変化させる可能性がある。この変化は、LOC665622がクロマチンと相互作用する効率をさらに低下させ、クロマチンリモデリングにおけるLOC665622の正常な機能的役割を阻害する。これらの化学阻害剤はそれぞれ、ヒストンのアセチル化状態を変化させ、それによってクロマチン構造を変化させることで、LOC665622の機能を直接阻害することができるが、そのメカニズムは完全に一様ではなく、異なるHDAC酵素に対する選択性と効力において異なる可能性がある。
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