ラパマイシンによるmTORの阻害は、タンパク質合成速度の変化につながり、このプロセスに発現や機能を依存しているタンパク質に影響を与える可能性がある。トリコスタチンAのようなヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、クロマチン構造と遺伝子発現に変化をもたらし、LOC646823を含む多くのタンパク質の産生と機能に影響を及ぼす可能性がある。イブルチニブとABT-199は、それぞれB細胞とアポトーシス経路内のシグナル伝達を阻害し、これらのプロセスに関連するタンパク質の機能に広範な影響を及ぼす可能性がある。
エルロチニブやソラフェニブなどのチロシンキナーゼ阻害剤は、標的が細胞増殖、分化、血管新生に関与しているため、広範囲に作用する。クルクミンによるNF-κBの阻害は、様々な遺伝子の転写に影響を与え、この因子によって制御されるタンパク質に下流で影響を及ぼす可能性がある。シクロパミンによるヘッジホッグ経路のターゲティングは、細胞の分化と増殖の中心的なプロセスに影響を与える。スタウロスポリンは、広範なキナーゼ阻害剤として、細胞シグナル伝達経路に広範かつ広範囲な影響を及ぼし、多数のタンパク質の機能を変化させる可能性がある。最後に、ジレウトンの5-リポキシゲナーゼ阻害作用は、炎症反応に重要なロイコトリエンの合成に影響し、この経路に関連するタンパク質の機能に間接的に影響を及ぼす可能性がある。
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