LCE2A阻害剤は、LCE2Aが重要な役割を果たすケラチノサイトの分化と皮膚バリア機能に不可欠な特定の細胞経路を調節することにより、LCE2Aの活性を抑制する化学物質である。MEK阻害剤であるPD 98059やU0126のような化合物は、MAPK/ERK経路を抑制し、LCE2Aの活性を低下させる可能性がある。この経路は、LCE2Aの機能の中心であるケラチノサイトの分化に関与しているからである。同様に、PI3K阻害剤のLY 294002とPKA阻害剤のH-89は、それぞれケラチノサイトの増殖と分化を制御することが知られているPI3K/AKTとcAMP依存性シグナル伝達経路を阻害することによって、LCE2A活性を低下させる可能性がある。プロテインキナーゼCの異なるアイソフォームを阻害するロットレリンとカルフォスチンCは、皮膚細胞の分化に関与するシグナル伝達機構を変化させることにより、LCE2A活性を低下させる可能性がある。
さらに、LCE2Aが皮膚バリアの発達と維持に関与していることから、脂質シグナル伝達経路がその阻害の重要な標的となる可能性が示唆される。スフィンゴシンキナーゼ1を標的とするGW4869は、スフィンゴシン-1-リン酸やセラミドのようなシグナル伝達分子のレベルを低下させ、LCE2Aの活性低下につながる可能性がある。4-ヒドロキシフェニルレチナミドは、レチノイドシグナル伝達を調節することで、ケラチノサイトの分化を阻害し、LCE2A活性を低下させる可能性がある。さらに、ホスファチジルコリン特異的ホスホリパーゼCとファルネシルトランスフェラーゼをそれぞれ阻害するD609とマヌマイシンAは、皮膚細胞におけるLCE2Aの機能に影響を与える細胞内シグナル伝達の変化につながる可能性がある。ケラチノサイトの様々な機能に影響を与えることで、これらの阻害剤はLCE2Aの活性抑制に総合的に寄与している。
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