LANCL3の機能的活性は、特定の化学的活性化因子の影響を受ける様々なシグナル伝達経路を通して調節される。これらの活性化因子は異なるメカニズムで機能し、それぞれがLANCL3活性の調節に収束する。例えば、ある種の化合物はアデニル酸シクラーゼを直接刺激し、細胞内のcAMPレベルを上昇させる。同様に、一酸化窒素を放出し、グアニル酸シクラーゼを活性化し、cGMPレベルを上昇させる活性化剤もある。さらに、活性化因子の中には、直接あるいはGタンパク質共役型受容体を介して、細胞内のカルシウム濃度に影響を与えるものがあり、カルシウム依存性プロテインキナーゼを活性化し、LANCL3のリン酸化とその後の活性化につながる可能性がある。
さらに、セカンドメッセンジャーの細胞内濃度を調節することによって働く活性化剤もあり、その作用機序は様々で、分解を防いだり、蓄積を促進したりする。例えば、ホスホジエステラーゼの阻害やシグナル伝達分子の細胞透過性アナログの供給は、cAMPやcGMP依存性経路を持続的に活性化し、間接的にLANCL3活性を上昇させる。その他の化学的活性化剤は、様々なプロテインキナーゼやホスファターゼの活性を上昇させ、LANCL3を含む標的タンパク質のリン酸化状態を変化させる。さらに、ある種のポリフェノール化合物は、サーチュインやAMPKなどの細胞代謝やタンパク質機能の主要な制御因子を活性化し、LANCL3活性に影響を与える可能性がある。
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