LACE1の化学的阻害剤は、細胞代謝とミトコンドリア機能の様々な側面を標的として阻害を達成する。オリゴマイシンA、アンチマイシンA、ロテノン、TTFA、アジ化ナトリウム、アロプリノール、ボンクレキン酸、フェンホルミンはすべて、ATP産生に重要なミトコンドリアの電子伝達連鎖を異なる時点で阻害する。オリゴマイシンAはATP合成酵素を特異的に阻害し、LACE1のエネルギー依存性機能に利用可能なATPを直接的に減少させる。同様に、アンチマイシンAとロテノンはそれぞれ複合体IIIとIを阻害し、TTFAは複合体IIを標的とするが、いずれもATP合成を低下させる。アジ化ナトリウムは複合体IVの構成要素であるシトクロムcオキシダーゼに作用し、ATP産生をさらに低下させる。このATPの減少は、LACE1の活性に不可欠なエネルギー供給を低下させる。アロプリノールによるキサンチンオキシダーゼの阻害は、プリン代謝を変化させることで間接的にATPを減少させる。フェンホルミンはミトコンドリア複合体Iも阻害し、ATP合成に対するロテノンの効果を模倣することで、LACE1を阻害する。
さらに、CCCPと2-デオキシ-D-グルコースは、それぞれプロトン勾配と解糖を破壊する。CCCPはミトコンドリア内膜のプロトン勾配を崩し、LACE1に必要なATP産生を阻害する。これと並行して、2-デオキシ-D-グルコースは解糖を阻害する。解糖はATP生成のためのもう一つの重要な経路であり、LACE1の活動に不可欠である。ベシル酸アトラキュリウムはカルシウム異常症を誘発し、その活性はカルシウム濃度によって調節されるため、LACE1を阻害する可能性がある。コンカナマイシンAは、LACE1が活動する環境であるリソソームを酸性化するV-ATPaseを特異的に標的とする。したがって、コンカナマイシンAによるリソソームの酸性化阻害は、LACE1のリソソーム機能を阻害する。これらの化学物質はすべて、LACE1が機能するのに必要なエネルギーバランスと細胞条件を破壊し、細胞内でのLACE1の活性を効果的に阻害する。
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