KLHL20阻害剤は、様々な生化学的経路を通じて間接的にKLHL20の機能的活性を抑制する多様な化合物群である。MG-132、ボルテゾミブ、ラクタシスチン、エポキソマイシンなどのプロテアソーム阻害剤は、ユビキチン化されたタンパク質の分解を阻害することにより、KLHL20の基質を細胞内に蓄積させ、KLHL20が新たな基質をユビキチン化できるターンオーバー速度を効果的に低下させる。この基質の飽和は、タンパク質分解を促進するKLHL20の機能的能力を妨げ、それによって間接的にその活性を阻害する。同様に、MLN4924は、NEDD8活性化酵素を阻害することによって、KLHL20が構成因子であるカリン-RINGリガーゼの活性に重要なネディレーションプロセスを阻害する。この翻訳後修飾が阻害されると、KLHL20のユビキチンリガーゼ活性が著しく低下する。KLHL20の基質であるp62の増加をもたらすクロロキンによるオートファジー阻害の影響もまた、KLHL20の機能阻害に寄与しており、カリン-リングE3リガーゼの基質認識を調節するサリドマイドの作用も同様である。
クルクミンやオールトランス型レチノイン酸のような化合物はKLHL20の転写レベルに影響を与え、クルクミンはNF-κB経路を阻害し、KLHL20の発現を低下させる可能性があり、オールトランス型レチノイン酸はレチノイン酸受容体を介して遺伝子発現を変化させ、KLHL20の発現や基質の利用可能性に影響を与える可能性がある。ICI182,780は、ユビキチン・プロテアソーム系内のタンパク質の発現を変化させることにより、間接的にKLHL20活性を低下させる可能性がある。最後に、Withaferin AとCelastrolは、それぞれプロテアソーム分解経路と熱ショックタンパク質を破壊し、KLHL20がその一部であるユビキチン化プロセスに間接的に影響を与える可能性がある。プロテアソームを介する分解、あるいはユビキチン化経路におけるタンパク質のフォールディングと安定性に影響を与えることにより、これらの化合物はKLHL20の酵素活性を間接的ではあるが効果的に低下させ、機能的阻害剤として機能する。それぞれの阻害剤は、その特異的なメカニズムにより、KLHL20の転写や翻訳を直接変化させることなく、むしろKLHL20が本来関与している生化学的経路や細胞プロセスに影響を与えることによって、KLHL20の活性を確実に低下させる。
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