HoxD9 アクチベーター

一般的なHoxD9活性化剤には、レチノイン酸、all trans CAS 302-79-4、5-アザシチジン CAS 320-67-2、トリコスタチン A CAS 58880-19-6、バルプロ酸 CAS 99-66-1、および酪酸ナトリウム CAS 156-54-7などがあるが、これらに限定されない。

HoxD9はホメオボックス（Hox）遺伝子ファミリーのメンバーであり、胚発生とボディプランの決定に重要な転写因子をコードしている。HoxD9を含むこれらの転写因子はDNAに結合し、形態形成や四肢や器官の発達に関与する遺伝子の発現を制御する。化学的分類としてのHoxD9活性化剤は、HoxD9の転写活性を直接的または間接的に刺激することができる化合物である。

直接的なHoxD9活性化剤は、DNAと結合して遺伝子の転写を活性化する能力を高めるような形でHoxD9タンパク質と相互作用することができる。これは、タンパク質のコンフォメーションを特定のDNA配列に対してより親和性の高い状態に変化させたり、HoxD9とその補因子（効率的な転写にしばしば必要である）との相互作用を安定化させたりするなど、様々なメカニズムで起こりうる。活性化因子は、DNA結合ドメインとは異なる部位でHoxD9タンパク質に結合する可能性があり、これはDNAとの結合競合を回避する戦略であり、活性化因子が非競合的に影響を及ぼすことを可能にする。間接的HoxD9活性化因子は、HoxD9活性を調節する細胞環境またはシグナル伝達経路に影響を与えることによって働くであろう。これには、HoxD9遺伝子自体の発現をアップレギュレートし、それによって細胞内のHoxD9タンパク質の量を増加させる低分子が含まれるかもしれない。その他の間接的活性化因子は、HoxD9に結合して転写を活性化する能力を抑制するタンパク質など、HoxD9の負の制御因子を阻害する可能性がある。さらに、間接的活性化因子は、HoxD9やその共因子のリン酸化、アセチル化、メチル化などの修飾に影響を与え、転写因子の活性や安定性に影響を与える可能性がある。