HMG I活性化剤は、クロマチン配列やDNAメチル化パターンを変化させることにより、HMG Iの機能的活性を間接的に増強する化合物の一種である。ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるボリノスタットとトリコスタチンAは、ともにクロマチン構造を弛緩させ、HMG Iの結合部位へのアクセス性を高め、遺伝子制御におけるその役割を増強すると考えられる。同様に、5-アザシチジンとその類似体であるRG108は、DNAメチル化酵素を阻害することによってDNAメチル化レベルを低下させ、HMG Iの機能により従順なクロマチン状態に導く可能性がある。ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤として作用する酪酸ナトリウムとバルプロ酸、そしてDNAにインターカレートするクロロキンはすべて、クロマチンを組織化し遺伝子発現に影響を及ぼすHMG Iの活性を促進するクロマチン構造に寄与する。
さらに、ミトラマイシンAはDNAに結合し、HMG Iの活性に有利な形でクロマチンランドスケープを変化させる可能性がある。強力なヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるロミデプシンやパノビノスタット、そしてヒストン脱アセチル化酵素に特異的に作用することで知られるMS-275(エンチノスタット)は、HMG Iの結合や調節機能に有利なクロマチン状態を促進することにより、この効果にさらに寄与する。デシタビンは5-アザシチジンと同様にDNAの低メチル化を誘導し、HMG Iの活性を高める可能性がある。まとめると、これらの化合物は、クロマチンダイナミクスとDNAメチル化に対する標的効果を通して、HMG Iの機能的活性を高める環境を促進し、それによって転写や翻訳を直接変化させることなく、遺伝子発現を制御する能力に間接的に影響を与える。
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