ヘモグロビンζ阻害剤には、ヘモグロビンζの発現、合成、安定性に間接的に影響を及ぼす様々な化合物が含まれる。これらの阻害剤はヘモグロビンζに直接結合するのではなく、赤血球内のヘモグロビンζのレベルや機能の変化につながる様々な生理学的・生化学的経路を調節する。例えば、ヒドロキシ尿素と酪酸は胎児ヘモグロビンの産生を増加させ、ヘモグロビンζの正常な発現パターンと競合したり、乱したりする可能性がある。同様に、5-アザシチジンやデシタビンなどのDNAメチル化酵素阻害剤は、胎児ヘモグロビン遺伝子の再活性化につながるエピジェネティックな変化を引き起こし、それによってヘモグロビンζの相対的発現に影響を与える可能性がある。
その他の化学物質も、間接的にヘモグロビンの合成や安定性に影響を与える可能性がある。例えば、三酸化ヒ素や塩化コバルトは、低酸素誘導因子などの転写因子に影響を与えることにより、遺伝子発現を調節することができる。ラパマイシンはmTOR経路を阻害することによって作用し、ヘモグロビンのサブユニットを含むタンパク質合成に広範な影響を及ぼす可能性がある。クロロキンやメチレンブルーのような化合物は赤血球内の酸化還元状態に影響を与え、ヘモグロビンζを含むヘモグロビンの安定性と機能に影響を与える可能性がある。フラボノイドの一種であるケルセチンは、タンパク質のグリコシル化と安定性を変化させ、ヘモグロビンにも影響を与える可能性がある。最後に、ヘマチンとスタブジンは、ヘモグロビンζに特異的ではないが、それぞれヘモグロビンの機能性とDNA複製に影響を及ぼすことが知られており、ヘモグロビンζの発現と安定性に下流から影響を及ぼす可能性がある。
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