FBP21活性化剤は、転写調節やクロマチン構築への影響を通して間接的にFBP21の機能に影響を与える可能性のある化学物質である。5-アザシチジン、トリコスタチンA、SAHA、酪酸ナトリウム、レチノイン酸のような薬剤は、DNAメチル化やヒストン脱アセチル化を阻害することによりエピジェネティック修飾剤として機能し、クロマチンダイナミクスの変化をもたらし、ゲノム内の標的部位へのFBP21のアクセス性を高める可能性がある。β-エストラジオールやミトラマイシンAのような化合物は遺伝子発現に影響を及ぼすことが知られており、前者はエストロゲン受容体経路を介して作用し、後者はDNAに直接結合する。クロロキンのDNAへのインターカレーションは、DNA複製と転写プロセスに影響を与え、FBP21の機能的背景を変える可能性がある。
イソフラボンのゲニステインとポリフェノールのエピガロカテキンガレートは、それぞれシグナル伝達経路を標的とし、DNAメチル化とヒストン修飾パターンを修飾する。クルクミンはエピジェネティックな影響を持つもう一つの化合物で、遺伝子発現パターンへの影響を通してFBP21の活性を調節する可能性がある。最後に、S-アデノシルメチオニンは普遍的なメチル供与体として機能し、DNAやヒストンのメチル化パターンを変化させ、クロマチン構造の改変におけるFBP21の役割に影響を与える可能性がある。
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