FATE1阻害剤は主に、細胞の発生と機能におけるFATE1の役割と相互作用あるいは交差する可能性のある細胞経路を標的とする。FATE1を直接阻害することは依然として困難であるが、FATE1の機能的環境を取り囲むシグナル伝達カスケードを調節することで、FATE1の活性を間接的に制御できる可能性がある。スタウロスポリンのようなキナーゼ阻害剤は幅広い作用を示し、FATE1の役割と交差する可能性のある無数のシグナル伝達カスケードに影響を与える。さらに、WortmanninやLY294002のような阻害剤によって調節されるPI3K経路は、細胞シグナル伝達において極めて重要な役割を果たしており、間接的なFATE1調節の道を提供するかもしれない。
PD98059、U0126、SB203580が標的とするMAPK経路も興味深い。FATE1が細胞の発生と機能に関連していることを考えると、この経路を弱めたり調節したりすることは、FATE1の活性に影響を与えるかもしれない。2-APB、イオノマイシン、BAPTA-AM、タプシガルギンのような薬剤によって影響を受ける細胞カルシウム動態の複雑さは、FATE1のようなタンパク質の機能的景観を形成する細胞内シグナリングの重要性を強調している。
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