FANCC阻害剤は、FANCCが関与するDNA損傷応答および修復機構に影響を与えることによって、間接的にFANCCの機能的能力に影響を与える多様な化合物群からなる。これらの阻害剤は、FANCCと直接結合したり、FANCCを変化させたりするのではなく、DNA損傷量を増加させたり、FA経路が適切に機能するための前提条件である細胞プロセスを損なうことによって、その効果を発揮する。そうすることで、FANCCが重要な構成要素であるFA経路に負担をかけ、タンパク質の機能阻害につながる可能性がある。
これらの化合物は、DNA架橋剤、DNA合成阻害剤、キナーゼ阻害剤、プロテアソーム阻害剤、ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ(PARP)阻害剤など、主な作用機序に基づいてグループ分けすることができる。DNA架橋剤は、FA経路の基質となる病変を生成する。この修復システムに過負荷をかけると、間接的にFANCCの活性を阻害する可能性がある。キナーゼ阻害剤は、FA経路を活性化するシグナル伝達カスケードを破壊し、おそらくFANCCの機能阻害につながる。プロテアソーム阻害剤は、損傷タンパク質の蓄積を引き起こし、FA経路を含むDNA修復機構の構成要素を隔離することによって、間接的にFANCCを障害する可能性がある。さらに、PARP阻害剤はPARP酵素をDNA上に捕捉し、シグナル伝達や修復におけるPARP酵素の正常な働きを妨げるため、DNA切断や複製分枝の崩壊が増加する。このようにゲノムの不安定性が高まると、FA経路とその中でのFANCCの役割が間接的に問われることになる。
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