DsRed阻害剤
一般的なDsRed阻害剤としては、アクチノマイシンD CAS 50-76-0、シクロヘキシミドCAS 66-81-9、α-アマニチンCAS 23109-05-9、フルオロウラシルCAS 51-21-8、リファンピシンCAS 13292-46-1が挙げられるが、これらに限定されない。
DsRedは、サンゴ種Discosoma sp.に見られる赤色蛍光タンパク質であり、その独特の赤色蛍光がGFPの緑色蛍光と対比するため、分子生物学において広く応用されています。時間の経過とともに、変異誘発によってmCherry、mStrawberry、mRaspberryなどのDsRedのバリアントが開発され、それぞれが特定の研究ニーズに合わせた独自の特性を提供しています。DsRedの蛍光の中心には、タンパク質マトリックス内で翻訳後に形成されるクロモフォアがあります。このクロモフォアは、ある波長の光を吸収し、別の波長で放出することで観察される赤色蛍光を生み出します。このクロモフォアの成熟は、一連の化学反応を伴い、pHや酸素レベルなどの要因によって影響を受けることがあります。
DsRedの機能を抑制する方法として、いくつかの戦略が考えられます。転写および翻訳の阻害剤は、RNA干渉（RNAi）やアンチセンスオリゴヌクレオチドのような技術を用いてDsRedのmRNAを標的にすることで、DsRedの生成を抑制することができます。クロモフォアの成熟を妨げることや、蛍光消光剤の導入によってDsRedの蛍光を減少させることも可能です。さらに、プロテアーゼによる分解を通じてDsRedを分解の対象とすることや、pHの調整や低酸素条件などの環境要因がその蛍光に影響を与えることもあります。DsRedは通常の標的として抑制されることは少ないですが、その調節メカニズムを理解することは、このツールを使用する研究者にとって重要な洞察を提供します。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Actinomycin D | 50-76-0 | sc-200906 sc-200906A sc-200906B sc-200906C sc-200906D | 5 mg 25 mg 100 mg 1 g 10 g | $74.00 $243.00 $731.00 $2572.00 $21848.00 | 53 | |
アクチノマイシンDはDNAに結合し、RNAポリメラーゼを阻害する。この作用はDsRed遺伝子の転写を阻害し、その発現を低下させる可能性がある。 | ||||||
Cycloheximide | 66-81-9 | sc-3508B sc-3508 sc-3508A | 100 mg 1 g 5 g | $41.00 $84.00 $275.00 | 127 | |
シクロヘキシミドは真核生物のタンパク質合成を阻害する。DsRed mRNAの翻訳を阻害し、DsRedタンパク質のレベルを低下させる。 | ||||||
α-Amanitin | 23109-05-9 | sc-202440 sc-202440A | 1 mg 5 mg | $269.00 $1050.00 | 26 | |
α-アマニチンはRNAポリメラーゼIIを阻害する。この作用はDsRed遺伝子の転写を妨げ、その発現を減少させる可能性がある。 | ||||||
Fluorouracil | 51-21-8 | sc-29060 sc-29060A | 1 g 5 g | $37.00 $152.00 | 11 | |
5-FUはDNA合成に影響を与えるチミジル酸合成酵素阻害剤である。それは間接的にDsRed遺伝子の転写を抑制するかもしれない。 | ||||||
Rifampicin | 13292-46-1 | sc-200910 sc-200910A sc-200910B sc-200910C | 1 g 5 g 100 g 250 g | $97.00 $328.00 $676.00 $1467.00 | 6 | |
リファンピシンは細菌のRNAポリメラーゼを阻害する。DsRedを発現している細菌では、これはDsRedの転写を減少させる可能性がある。 | ||||||
Chloramphenicol | 56-75-7 | sc-3594 | 25 g | $90.00 | 10 | |
クロラムフェニコールは細菌のタンパク質合成を阻害する。DsRedを発現している細菌では、これはDsRedタンパク質レベルを減少させる可能性がある。 | ||||||
Puromycin dihydrochloride | 58-58-2 | sc-108071 sc-108071B sc-108071C sc-108071A | 25 mg 250 mg 1 g 50 mg | $42.00 $214.00 $832.00 $66.00 | 394 | |
ピューロマイシンは翻訳中の早期鎖終結を引き起こす。これはDsRedタンパク質の完全な合成を妨げる可能性がある。 | ||||||
Tetracycline | 60-54-8 | sc-205858 sc-205858A sc-205858B sc-205858C sc-205858D | 10 g 25 g 100 g 500 g 1 kg | $63.00 $94.00 $270.00 $417.00 $634.00 | 6 | |
テトラサイクリンは細菌のタンパク質合成を阻害する。DsRedを発現している細菌では、これはDsRedタンパク質レベルの低下につながる可能性がある。 | ||||||
Quercetin | 117-39-5 | sc-206089 sc-206089A sc-206089E sc-206089C sc-206089D sc-206089B | 100 mg 500 mg 100 g 250 g 1 kg 25 g | $11.00 $17.00 $110.00 $250.00 $936.00 $50.00 | 33 | |
ケルセチンは、ある種の蛍光タンパク質を阻害することが示されている。その抗酸化作用はDsRedの蛍光を阻害するかもしれない。 | ||||||
Genistein | 446-72-0 | sc-3515 sc-3515A sc-3515B sc-3515C sc-3515D sc-3515E sc-3515F | 100 mg 500 mg 1 g 5 g 10 g 25 g 100 g | $45.00 $164.00 $200.00 $402.00 $575.00 $981.00 $2031.00 | 46 | |
ゲニステインはチロシンキナーゼを阻害し、シグナル伝達経路を阻害してDsRedの発現に影響を与える可能性がある。 | ||||||