DEAD-boxヘリカーゼファミリーの一つであるATP依存性RNAヘリカーゼDDX50は、RNAの二次構造の巻き戻しにおいて重要な役割を果たしており、この過程はRNAの転写、スプライシング、翻訳、崩壊など多くの細胞活動に不可欠である。これらのプロセスの基本的性質を考えると、DDX50の機能を調節することは、生化学および分子生物学の領域において重要な関心事である。
先に挙げた化合物に代表されるDDX50の阻害剤は、その作用機序に基づいてグループ分けすることができる。これらの阻害剤のいくつかは、ATPアナログのように、天然のATPと結合を競合させることによって機能し、DDX50のATPアーゼ活性を阻害することを目的としている。ATP結合ポケットでのこのような競合によって、DDX50はRNA解離活性の重要なステップであるATPの加水分解ができなくなる可能性がある。ケルセチン、ロスコビチン、ミリセチンのような化合物を含む別のグループは、様々なATP依存性酵素を阻害することが知られており、ATP結合や加水分解に影響を与えることでDDX50を阻害している可能性が示唆される。さらに、スラミンやアクラルビシンのようなある種の分子は核酸と直接相互作用し、DDX50がRNA基質と結合したりほどけたりするのを阻害する可能性がある。さらに、オキサリプラチンやエトポシドのような化合物は、主にDNAプロセスに影響を与えるが、間接的にDDX50が作用する環境に影響を与え、DDX50の機能を変化させる可能性がある。要するに、DDX50に対するこれらの阻害剤の正確な作用機序や特異性は、まだ十分に研究されていないが、ATP依存性のプロセスや核酸構造と相互作用する可能性があるため、RNAヘリカーゼの機能研究において興味深い分子である。
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| 製品名 | CAS # | カタログ # | 数量 | 価格 | 引用文献 | レーティング |
|---|---|---|---|---|---|---|
Quercetin | 117-39-5 | sc-206089 sc-206089A sc-206089E sc-206089C sc-206089D sc-206089B | 100 mg 500 mg 100 g 250 g 1 kg 25 g | $11.00 $17.00 $108.00 $245.00 $918.00 $49.00 | 33 | |
ケルセチンは様々なATP依存性酵素を阻害することが知られている。ATPの結合または加水分解を阻害することにより、DDX50を阻害する可能性がある。 | ||||||
Roscovitine | 186692-46-6 | sc-24002 sc-24002A | 1 mg 5 mg | $92.00 $260.00 | 42 | |
ロスコビチンはサイクリン依存性キナーゼ阻害剤であるが、他のATP結合タンパク質に対しても阻害作用を示す。DDX50のATPアーゼ活性を阻害するかもしれない。 | ||||||
Silybin | 22888-70-6 | sc-202812 sc-202812A sc-202812B sc-202812C | 1 g 5 g 10 g 50 g | $54.00 $112.00 $202.00 $700.00 | 6 | |
シリビニンは他のRNAヘリカーゼを阻害することが示されている。シリビニンはDDX50のATPaseまたはRNA結合機能を阻害することにより、DDX50を阻害するかもしれない。 | ||||||
Myricetin | 529-44-2 | sc-203147 sc-203147A sc-203147B sc-203147C sc-203147D | 25 mg 100 mg 1 g 25 g 100 g | $95.00 $184.00 $255.00 $500.00 $1002.00 | 3 | |
ケルセチンと同様に、ミリセチンはいくつかのタンパク質におけるATP結合を阻害し、DDX50のATPアーゼ活性を阻害する可能性がある。 | ||||||
Suramin sodium | 129-46-4 | sc-507209 sc-507209F sc-507209A sc-507209B sc-507209C sc-507209D sc-507209E | 50 mg 100 mg 250 mg 1 g 10 g 25 g 50 g | $149.00 $210.00 $714.00 $2550.00 $10750.00 $21410.00 $40290.00 | 5 | |
Suraminは、タンパク質-タンパク質、タンパク質-核酸の相互作用を阻害する可能性のある薬剤である。RNA結合能力に影響を与えることにより、DDX50を阻害する可能性がある。 | ||||||
Oxaliplatin | 61825-94-3 | sc-202270 sc-202270A | 5 mg 25 mg | $110.00 $386.00 | 8 | |
オキサリプラチンはDNA付加体を形成する薬剤である。主にDNAプロセスに影響を与えるが、RNA代謝にも影響を与え、それによってDDX50の機能にも影響を与える可能性がある。 | ||||||
Aclacinomycin A | 57576-44-0 | sc-200160 | 5 mg | $129.00 | 10 | |
アクラルビシンはDNAやRNAにインターカレートする。RNAに結合することにより、RNA構造をほどくDDX50の能力を阻害する可能性がある。 | ||||||
Berberine | 2086-83-1 | sc-507337 | 250 mg | $90.00 | 1 | |
アルカロイドの一種であるベルベリンは、DNAやRNAと相互作用することが知られている。DDX50のRNA結合あるいは巻き戻し活性を阻害する可能性がある。 | ||||||
Ellagic Acid, Dihydrate | 476-66-4 | sc-202598 sc-202598A sc-202598B sc-202598C | 500 mg 5 g 25 g 100 g | $57.00 $93.00 $240.00 $713.00 | 8 | |
エラグ酸はいくつかのRNAヘリカーゼに対して阻害作用を示す。エラグ酸はDDX50のRNA結合や巻き戻し能力に影響を与えるかもしれない。 | ||||||
Etoposide (VP-16) | 33419-42-0 | sc-3512B sc-3512 sc-3512A | 10 mg 100 mg 500 mg | $32.00 $170.00 $385.00 | 63 | |
エトポシドはDNAトポイソメラーゼを阻害する。その主な作用はDNAの代謝であるが、RNAに対するDDX50の活性に影響を与える副次的な作用があるかもしれない。 | ||||||