D54の化学的阻害剤には、このタンパク質の活性制御に関与する様々なキナーゼやシグナル伝達経路を標的とする様々な化合物が含まれる。スタウロスポリンは、シグナル伝達経路内でD54の活性化に重要なタンパク質キナーゼを標的としてD54を阻害することができる。D54の上流または下流にあるタンパク質のリン酸化を阻害することにより、スタウロスポリンはD54がその一部である正常なシグナル伝達カスケードを破壊し、機能阻害に導く。同様に、プロテインキナーゼC(PKC)の選択的阻害剤であるBisindolylmaleimide Iは、D54の機能に必要なリン酸化事象を減少させ、それによってD54を阻害することができる。LY294002とWortmanninは、どちらもホスホイノシチド3キナーゼ(PI3K)阻害剤であり、D54のようなタンパク質の制御にしばしば関与するPI3K/Akt経路を破壊することにより、D54を阻害することができる。
マイトジェン活性化プロテインキナーゼ(MEK)を阻害するU0126とPD98059は、MAPK経路内の細胞外シグナル制御キナーゼ(ERK)の活性化を防ぐことができる。D54の活性はMAPK経路によって調節されるため、MEK、ひいてはERKを阻害することは、D54の機能阻害につながる。p38MAPKを阻害するSB203580とc-Jun N末端キナーゼ(JNK)を阻害するSP600125も、D54活性を調節するそれぞれの経路内の調節シグナルを阻害することにより、D54を機能的に阻害することができる。ラパマイシンは哺乳類ラパマイシン標的(mTOR)を阻害し、D54はmTORによって制御される経路と関連している可能性があるので、その阻害はD54の機能に必要なシグナル伝達を阻害することによって、D54の活性を低下させることができる。PP2は、Srcファミリーチロシンキナーゼの阻害剤として、チロシンリン酸化によるD54の制御を妨げることにより、D54の活性を低下させることができる。上皮成長因子受容体(EGFR)チロシンキナーゼの阻害剤であるゲフィチニブとエルロチニブは、D54活性を調節するはずのEGFRによって制御される経路における下流のシグナル伝達事象を阻害することによって、D54を阻害することができる。これらの化合物によるEGFRの阻害は、D54活性を制御するシグナル伝達経路を破壊し、機能阻害につながる。
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