COX3阻害剤は、主にシクロオキシゲナーゼ酵素、特にCOX1とCOX2を阻害する能力で知られる様々な化合物で構成されている。COX3を直接阻害することはあまり報告されていないが、これらの化合物は、COX酵素ファミリーに広く作用することにより、COX3に影響を及ぼす可能性がある。アスピリン、イブプロフェン、ナプロキセン、インドメタシン、ジクロフェナク、ケトロラク、ピロキシカム、フルルビプロフェンなどの化合物は、伝統的な非選択的COX阻害剤である。これらは、COX1とCOX2の両方の酵素を阻害し、その結果、特に痛みや炎症に関連する経路において、COX3の活性に影響を及ぼす可能性がある。例えば、アスピリンはCOX酵素を不可逆的に阻害し、プロスタグランジン合成や炎症経路におけるCOX3の役割に影響を与える可能性がある。同様に、非選択的COX阻害剤であるイブプロフェンやナプロキセンは、COX3を介するプロスタグランジン合成を低下させる可能性がある。
セレコキシブ、メロキシカム、ロフェコキシブのような選択的COX-2阻害薬は主にCOX-2を標的とするが、COX酵素ファミリーの構造的・機能的類似性からCOX3にも影響を及ぼす可能性がある。例えば、CelecoxibのCOX-2に対する選択的阻害作用はCOX3にも及び、特定の生理的状況においてCOX3の活性に影響を及ぼす可能性がある。アセトアミノフェンは伝統的なNSAIDではないが、中枢性のCOX酵素を阻害すると考えられており、COX3に影響を与える可能性がある。その作用機序は、特に中枢神経系においてCOX3活性を低下させる可能性を示唆している。
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