COMMD3活性化因子は、主に様々なキナーゼやホスホジエステラーゼの活性を調節することにより、様々な生化学的メカニズムを通じて影響を及ぼすことができる。活性化因子の中には、アデニル酸シクラーゼを標的とするものがあり、細胞内のcAMPを増加させ、プロテインキナーゼAを活性化させる。活性化されたPKAは、リン酸化できる基質の範囲が広く、このリン酸化カスケードがCOMMD3にも及び、その活性を高める。他の活性化因子は、cAMPやcGMPを分解するホスホジエステラーゼを阻害することによって働き、細胞内にこれらの環状ヌクレオチドが蓄積される。その結果、cAMPやcGMPのレベルが上昇し、それぞれのプロテインキナーゼをさらに刺激する。これらのキナーゼは、様々なタンパク質をリン酸化することにより、COMMD3も標的とし、その機能的役割を増幅させる可能性がある。
さらに、いくつかの活性化因子は、カルシウムシグナル伝達や細胞骨格に影響を与えることにより、COMMD3に影響を及ぼす。例えば、ある種の活性化因子は細胞内のカルシウム濃度を上昇させ、COMMD3の機能を改変することができるカルシウム依存性プロテインキナーゼを活性化する。別のアプローチとして、細胞骨格ダイナミクスを阻害する活性化剤は、COMMD3の活性を制御するシグナル伝達経路を間接的に改変することができる。これにはRho関連プロテインキナーゼのようなキナーゼの阻害が含まれ、このキナーゼはCOMMD3の活性化を含む下流への影響を持つ可能性がある。その他の活性化因子は、グリコーゲン合成酵素キナーゼやヒストン脱アセチル化酵素などの酵素を阻害し、その結果、遺伝子発現や細胞内シグナル伝達過程に変化が生じ、COMMD3の活性を間接的に促進する。
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