CLAMP阻害剤は、特定のシグナル伝達経路によって制御される細胞内プロセスに関与するタンパク質であるCLAMPの活性を低下させる化合物である。このような阻害剤のひとつにオルソバナジン酸ナトリウムがあり、タンパク質チロシンホスファターゼを阻害することで、CLAMPが相互作用する可能性のあるタンパク質のリン酸化状態を維持し、最終的にCLAMPの機能を変化させる。強力なキナーゼ阻害剤であるスタウロスポリンは、CLAMPの相互作用タンパク質を制御する可能性のあるタンパク質キナーゼの活性に影響を与え、CLAMPの機能を変化させる。プロテインホスファターゼ阻害剤であるオカダ酸は、脱リン酸化を阻害することでCLAMPの相互作用プロファイルを変化させ、CLAMPの機能的活性を低下させる。チロシンキナーゼ阻害剤であるゲニステインは、CLAMPと相互作用するタンパク質のチロシンリン酸化を阻害し、CLAMPの機能を阻害する。
選択的MEK阻害剤であるPD98059は、Erk1/2シグナル伝達経路の活性を低下させ、CLAMPのタンパク質相互作用ネットワークを変化させる。強力なJNK阻害剤であるSP600125は、JNKシグナル伝達を阻害し、相互作用パートナーに影響を与えることでCLAMPの機能活性に影響を与える。SB203580はp38 MAPKの特異的阻害剤であり、この経路を阻害することでCLAMPの機能活性に影響を与える。PI3K阻害剤であるLY294002は、PI3K/Akt経路を阻害し、CLAMPと相互作用するタンパク質の機能活性を変化させる。MEK1およびMEK2阻害剤であるU0126は、MEK/ERK経路を阻害し、CLAMPと相互作用するタンパク質の機能活性に影響を与える。Y-27632はRho-associated protein kinases(ROCK)を選択的に阻害し、Rho/ROCK経路によって調節されるタンパク質の活性状態を変化させ、CLAMPに影響を与える。KN-93は、Ca2+/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼII(CaMKII)阻害剤であり、CLAMPと相互作用し、CaMKII経路によって調節されるタンパク質の機能活性に影響を与える。
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