CIB2の化学的阻害剤は、カルシウムシグナル伝達経路の様々な側面を標的としており、それはタンパク質の機能にとって極めて重要である。W-7塩酸塩、トリフルオペラジン、塩化カルミダゾリウムは、カルシウムが介在する過程でCIB2と相互作用するタンパク質であるカルモジュリンを阻害する例示的な化学物質である。カルモジュリンと拮抗することにより、これらの阻害剤はCIB2の正常なカルシウム依存性調節活性を妨げる。CIB2の活性はカルシウムによって調節されるため、ニフェジピン、ベラパミル、ジルチアゼム、ベプリジルなどのL型カルシウム拮抗薬の使用は、カルシウムの流入を減少させ、CIB2が結合できるカルシウムを減少させることにより、間接的にCIB2を阻害することができる。このような細胞内カルシウムレベルの低下は、活性化とそれに続くシグナル伝達をカルシウム結合に依存しているCIB2の機能低下に直接つながる。
さらに、リン酸KN-93のような阻害剤は、カルシウム/カルモジュリン依存性プロテインキナーゼII(CaMKII)を阻害することにより、カルシウムシグナルの下流への影響を阻害し、その結果、これらの経路におけるCIB2の活性が機能的に阻害される可能性がある。ML-9は、主にミオシン軽鎖キナーゼの阻害剤であるが、CIB2が関与するカルシウムシグナル伝達経路内のキナーゼにも影響を与え、CIB2の機能を変化させる。フェノチアジンは、カルモジュリン活性に影響を与えることでカルシウムシグナル伝達を阻害し、カルモジュリンとCIB2の結合を阻害して、カルシウムを介するタンパク質の機能を阻害する。T型カルシウムチャネル遮断薬であるミベフラジルは、L型遮断薬と同様に細胞内カルシウム濃度を低下させ、CIB2の機能を阻害する。最後に、ルテニウムレッドは、カルシウムの取り込みを阻害し、カルシウム結合タンパク質に結合することで、CIB2に結合し、そのカルシウム結合部位をブロックすることにより、CIB2の活性を阻害することができる。
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