CHRDL1の化学的阻害剤は、CHRDL1が相互作用するシグナル伝達経路の様々な側面、特に骨形態形成タンパク質(BMP)経路を標的とする。シクロパミンは、CHRDL1が調節するBMP経路と交差するヘッジホッグシグナル伝達経路を阻害することによって作用する。そうすることによって、シクロパミンはCHRDL1がBMPシグナルに影響を与える能力を低下させることができる。LDN-193189とDMH1はどちらもBMP受容体キナーゼ阻害剤である。これらの化学物質はBMP受容体の活性を直接阻害するため、CHRDL1がBMPシグナル伝達を効果的に調節するのを妨げる。SB-431542は、BMPシグナル伝達と密接な関係にあるTGF-β経路内のアクチビン受容体様キナーゼに選択的である。SB-431542によるこれらのキナーゼの阻害は、続いてBMPシグナル調節に関与するCHRDL1の機能的活性を低下させる。BMPタイプIレセプターALK2、ALK3、ALK6に対する阻害作用を持つドルソモルフィンもまた、CHRDL1がその作用を発揮するレセプターをブロックすることにより、CHRDL1の活性低下に寄与している。
さらに、ノギンはBMPに直接結合し、レセプターとの相互作用を阻害するため、BMP経路におけるCHRDL1の調節的役割を阻害する。チェトミンの低酸素誘導因子(HIF)経路の破壊は、HIFの影響を受ける血管形成過程に関与するCHRDL1に間接的に影響を与える可能性がある。K02288、LDN-214117およびLDN-212854は、ALK2およびALK3の阻害剤として、BMP受容体キナーゼを特異的に標的とし、BMP媒介シグナル伝達におけるCHRDL1の機能的影響を減少させる。A-83-01は、ALK5、ALK4、およびALK7を阻害することにより、BMPが属するTGF-βスーパーファミリーにおけるそれらの役割により、間接的にCHRDL1の活性を低下させることもできる。最後に、ALK1とALK2に対する選択的阻害剤であるML347は、これらの重要な受容体を阻害することにより、BMPシグナル伝達におけるCHRDL1の調節機能を低下させ、BMP経路とその中でのCHRDL1の役割を減弱させることができる。
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